利用BCR四步分级提取法分析三沙湾表层沉积物中6种重金属（Cr、Co、Ni、Cu、Zn、Pb ) 不同赋存形态的含量，阐述了重金属赋存形态与其环境因子关系，并采用次生相与原生相分布比法（RSP )和潜在生态危害指数法评价沉积物中重金属环境风险程度。结果表明，Pb主要以铁锰氧化物结合态为主，其他重金属以残渣态为主。重金属Co、Ni、Cu、Cr相互之间呈显著正相关，Pb与Zn呈显著正相关，有机碳与Co、Ni、Cu、Cr、Z n 呈显著正相关。评价结果显示Pb总体表现为中度污染，具有中等环境风险，其他重金属为无污染到轻度污染，环境风险较低。

本研究选取2017年4月采集的厦门湾鱼卵、仔稚鱼样品进行DNA 条形码分析。获得鱼卵、仔稚鱼的COI 基因序列27 条, 共鉴定种类11种,全部鉴定到种，隶属于4目9科11 属。在系统进化树的分析中, 同一种类的不同个体都聚在一支, 所有物种都分别聚为独立的一支, 这些物种都能有效地区分开来，说明利用COI基因可以进行有效的仔稚鱼物种鉴定。同时获取11种鱼类浮游生物高清图像，并描述其甄别性的形态特征。以上结果表明, 线粒体COI基因作为DNA 条形码可以实现鱼卵和仔稚鱼的物种鉴定, 且较多能鉴定到种的水平。

根据2016年5月（春）、8月（夏）、10月（秋）和2017年2月（冬）在安海湾调查所获得的资料，对安海湾浮游植物群落进行研究。结果表明, 浮游植物共鉴定6门68属139种，其中蓝藻5属5种，裸藻2属3种，绿藻4属8种，金藻1属1种，甲藻11属17种，硅藻45属105种。浮游植物种类以广布种为主，有较多淡水性种类存在。小环藻（未定种）、中肋骨条藻、菱形藻（未定种）、直链藻（未定种）、簇生布纹藻和聚生角毛藻等是优势的种类，其中小环藻（未定种）和中肋骨条藻在各季度月均为优势种。各季度月浮游植物细胞平均数量分别为22.26×104、6.23×104、10.61×104和54.21×104 cells/L，四个季度月平均为23.33×104 cells/L。浮游植物群落多样性指数平均为2.64。晋江经济开发区污水处理厂站位在低潮和高潮时浮游植物数量和多样性指数等变化大，裸藻和栅藻等耐污性种类数量相对较多。安海湾湾顶淡水对部分区域浮游植物有较大影响。浮游植物优势种和多样性指数等的变化表明安海湾浮游植物群落不稳定。